對于臨床醫學生來說，搞文章絕對是夢魘一般地存在。它無時無刻不環繞在大家的周圍，每每勞累之時，geyou躺時，抬頭間總能在頭上約50厘米的位置看到一個鬼魅般的影子縈繞在此。定睛一看發現是畢業要求的SCI！！！
如何才能優雅的發表一篇2~3分的SCI文章用來畢業，可能是很多醫學生朋友們糾結三年的事情。且聽hzangs給大家分享一篇文章，剝絲抽繭解讀內在的思路和方法。最后再附送一個2~3分臨床文章的精華思路。
抽絲剝繭解讀時間
文章標題：”Downregulation of exosome‐encapsulated miR‐548c‐5p is associated with poor prognosis in colorectal cancer.” （作者是復旦大學附屬中山醫院青浦分院和徐州醫學院附屬淮南醫院的醫生，發表在J Cell Biochem（IF=2.959）上）
主要內容：介紹miR‐548c‐5p與結直腸癌的關系。使用的外泌體分離方法是基于PEG原理的策略，miRNA抽提使用了常規的miRNA抽提kit。
文章的具體內容：
首先，收集108例結直腸癌患者病例，匯總病理特征→Table 1。
平均隨訪時間是44個月，相信很多醫院都有這樣的病例庫。病人信息匯總（有臨床樣本，就有病人信息匯總），無外乎分析一下年齡性別病理分期等。
檢測miR‐548c‐5p在肝轉移、病理分期、血管浸潤、淋巴結轉移方面是否有差異→Figure 1。
由于作者之前研究過一些miRNA在結直腸癌患者血清外泌體中的豐度，所以直接切入了miR‐548c‐5p。如果你沒有，那就自己找十幾個在其他癌癥中比較重要的miRNA來測一測，總有一兩個適合你！作者最后的結論是miR‐548c‐5p在肝轉移和病理分期方面存在差異，有肝轉移的患者miR‐548c‐5p表達低于無肝轉移的患者，晚期患者miR‐548c‐5p表達低于早期患者，而miR‐548c‐5p表達和血管浸潤、淋巴結轉移方面未發現明顯差異。
miR‐548c‐5p影響腫瘤細胞的功能→Figure 2。
看到了表達差異，總要解釋一下血清外泌體中miR‐548c‐5p的潛在功能。miRNA嘛，自然想到它的靶基因，找個數據庫預測一下就可以看到一些靶基因。作者發現miR‐548c‐5p的靶基因包括了IL6、IL8、IL17A、STAT3、JAK1等一系列的腫瘤明星分子，既然有這么多腫瘤明星分子，那就用miR‐548c‐5p高表達患者的血清外泌體和低表達的做個對比吧。用HCT116細胞做個共培養，CCK8測一下發現前者抑制細胞活力。那是通過促進還是抑制增殖來實現的呢？EdU標記顯示miR‐548c‐5p高表達病人的血清外泌體抑制了HTC116的增殖。就此機制探討結束。
miR‐548c‐5p表達對疾病預后的影響→Figure 3（K-M plot）
文章的內容到此結束。剩余部分就是討論了。
不難吧？很簡單吧？這就是一篇IF=2.959分的文章哦。
總結一下思路，文章就是從108例平均隨訪44個月的結直腸癌患者血清樣本入手，發現血清外泌體miR‐548c‐5p在肝轉移患者中的表達相對較低，在病理分期靠后的病人里表達較低。體外實驗做了CCK8和EdU染色證明miR‐548c‐5p影響了細胞增殖。生存分析發現miR‐548c‐5p高表達的預后較好。結束。概括如下圖：
現在開始最重要的部分。
文章背后的邏輯！
看似作者很幸運，發現這個miRNA有著非常重要的功能，并且和預后有關。但是具體分析一下就會發現其中一些小竅門：
1、 細心一些的朋友肯定發現了一個問題：為什么在108例樣本中區分miR‐548c‐5p的高低表達后不是54例低表達VS 54例高表達，而是87例低表達 VS 21例高表達。其實這是一個很重要的點，很多時候我們習慣使用中位值來區分樣本集中基因的表達高低。但是你使用四分位的25% VS 75% 或者 75% VS 25%也是可以的，你使用108例樣品的均值來區分也是可以的，甚至你發現樣本中基因表達存在一個明顯的斷檔，你用這個斷檔來區分高低也是可以說的通的。只要你可以解釋清楚你如何將樣本集中的樣本依據基因A表達水平分成基因A高表達和基因A低表達的兩組即可。而這篇文章正是采用了一個不常規的分組策略。
2、 Figure 1中分析了miR‐548c‐5p與轉移、病理分期、血管浸潤、淋巴結轉移的相關性。發現了其與轉移和病理分期存在相關性。這是一個很有技巧的分析方法。與腫瘤相關的指標有很多，比如某些特征基因的表達情況、病理分期、組織分型、侵襲、浸潤、轉移、腫瘤轉移靶器官等等，如果你喜歡，你可以列出腫瘤的幾十個特征，每一個特征都分析一下，你關注的基因總會在幾個特征指標中有差異。
3、 MiRNA的靶基因預測可以出現幾百甚至上千個基因，總有一些基因與你關注的生理病理過程相關。而血清來源的外泌體處理細胞，87例低表達樣品和21例高表達樣品中總有后者對細胞抑制比前者強的出現。畢竟，這篇文章中的這個實驗作者也只是使用了幾例樣本來做的，并沒有108例全用上。這也是一個大家很容易忽略的點。
4、 文章的Figure 3 （K-M plot ）的差異十分顯著。其實這就與問題1中的如何區分基因表達高低很相關了。試想，如果作者使用54 VS 54，那這個K-M plot 肯定不會有如此好看的差異。
5、 最容易被忽略的discussion部分：一個好的discussion可以對文章的內容有一個拔高。比如這篇文章，很多時候審稿人未必清楚你這篇文章的意義所在，好的discussion應該將文章發現與最新進展放在一起來討論。這樣可以告訴大家，你的數據為這個領域的發展帶來了什么樣的促進作用。
6、 文章被拆解分析完了。雖然其中有一些值得商榷的地方，但是文章的數據和結論還是非常值得我們了解和認識的。畢竟每一篇論文都對科學進步有不可磨滅的推進作用。
總結一下，看似很模式化的臨床分析型的研究性論文，其中依舊有很多可以改進和完善的地方，這樣的改進和完善能夠讓你的論文數據顯得很吸引人。這也是很多時候大家會忽略的地方。“拿到數據如何展示給大家”這是一門學問。今天的這篇文章就介紹到這里。希望大家有所收獲，也十分歡迎大家在留言區討論！
O(*￣—￣*)o 讓我們沐浴秋風，收獲paper~ 大家加油~
科研學習班了解一下~ ~（點擊詳細了解）：
不做實驗，不寫meta分析，用這個方法輕輕松松發多篇SCI論文
回復“外泌體” 閱讀外泌體最新科研進展及動態
回復“EV” 閱讀 2016-2018年This Week in Extracellular Vesicles
回復“盤點” 閱讀 外泌體領域十大前沿進展盤點
