強直性脊柱炎的病理改變包括肌腱骨附著點炎（腱端炎）和滑膜炎。在強直性脊柱炎的中軸關節，導致關節損害和強直的病理改變主要是腱端炎。雖然強直性脊柱炎也常常累及外周滑膜關節（如膝關節、踝關節等），但卻很少出現類風濕關節炎樣的骨侵蝕，這一現象目前尚未有確切的科學解釋。有學者認為，在類風濕關節炎的病理改變中，破骨細胞起了重要的作用，因破骨大于成骨，故出現明顯的骨吸收；在強直性脊柱炎，則成骨大于破骨，所以更易形成骨贅。
髖關節病變與真正的外周關節還不完全一樣，有些學者認為髖關節既不屬于中軸關節，也不是外周關節，而被稱為根關節。根關節還包括胸鎖關節、肩鎖、肩等。
實際上，髖關節既是滑膜關節，也有肌腱骨附著點（園韌帶等）。因此，強直性脊柱炎的髖關節損害，可能包含著2個類型的病理改變，即滑膜炎和腱端炎。
