肛門疾病有痔瘡，痔瘡又分了內痔、外痔、混合痔，其次還有肛裂、肛周膿腫、肛瘺、肛乳頭肥大、肛竇炎、直腸炎、直腸前突、直腸脫垂、直腸息肉、肛門失禁、肛管癌、直腸癌，還有尖銳濕疣、肛門外傷等。這里面的疾病有些是比較輕的，有些病情比較嚴重。比較輕微的是痔瘡，也是肛腸科最常見的疾病。痔瘡根據情況決定是手術還是用藥。像必須手術的疾病有肛裂、肛周膿腫、肛瘺、肛乳頭肥大、直腸息肉，這幾個疾病都是要必須做手術的。病情最嚴重的就是直腸癌，因為是屬于腫瘤，惡性疾病必須做手術，手術完之后還要根據情況做放療或者化療。其中一種疾病具有傳染性，屬于性病，就是肛門部的尖銳濕疣，尖銳濕疣是屬于性傳播疾病。
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