主要是與肛腸科常見的疾病相鑒別，比如痔瘡，痔瘡是最常見的疾病，尤其是內痔，它主要是出血，但是出血是鮮紅的血，大便后滴血或者噴血，有些痔瘡還會脫出到肛門外。
除此以外，大便它會很正常，不像得了息肉，有時候腹瀉，有時候腹痛，痔瘡沒有，而且通過醫生檢查能夠發現直腸末端出現隆起樣改變，如果出血期間，黏膜充血的顏色就有可能是鮮紅的。
第二個是肛裂，肛裂出血也會有，但是它有個典型的特征，就是便后有擦血，而且有排便撕裂樣疼痛，等到便后可能有間歇期，等間歇期過后又劇痛，是因為括約肌痙攣，肛裂也是導致便血的常見原因。
第三個要區別的就是肛乳頭的肥大，肛乳頭肥大它是來自于肛門的皮膚，很多人認為肛乳頭肥大就是直腸息肉，實際這兩個是截然不同的。因為肛乳頭肥大來自于皮膚，它輕易的不會出血，也不會癌變，很少有報道癌變的。
那么直腸的息肉，如果離著肛管比較近，它也像這個乳頭肥大一樣，就是很難區分。但是有一點，它黏膜的顏色是粉紅的，而且直腸息肉它容易出血，稍微碰撞或者刺激它，這個息肉就會出血，就是會很脆，這是截然不同的。因為直腸息肉來自黏膜，而肛乳頭肥大來自于皮膚，所以這也好鑒別。
再有就是直腸癌，一般直腸癌早期有時會便血，到后期就可能出現下墜，阻塞肛門，大便變細，當然了最后也是通過指檢或者腸鏡檢查來診斷，而且它最大的特點就是直腸癌占位。
占位的話，它有個隆起的病變，能夠把腸腔阻塞了，而直腸息肉它是柔軟的，活動的，不會有占位的感覺，它多半是蒂的，能夠活動的，而且范圍也沒有直腸癌大。直腸癌是硬的，它是來自于基底部的，而息肉多半來自于黏膜，腸癌可能來自于黏膜下層，那不一樣的。
再有潰瘍性結腸炎或者潰瘍性直腸炎也會出現出血，也會出現粘液便，但是腹瀉次數多，而且最終靠病理，靠腸鏡檢查，就能區分開潰瘍性結腸炎、潰瘍性直腸炎與息肉。
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