清廷對西藏的統御由來已久，皇太極時就遣使致書西藏的可汗和大喇嘛，順治帝對西藏問題的處理，就是對其父祖策略的成功延續。早在1642年，厄魯特蒙古和和碩特部領袖顧實汗，在五世達賴喇嘛的邀請下，率軍入藏，推翻的統治衛藏20多年的噶瑪噶舉教派的藏巴汗政權，成為西藏及青海地區的最高權力者。
這個地域空前寥廓的國家里，多民族聚居共存，處理好與邊疆各民族的關系，成為了入關后順治帝穩定政權的新挑戰，在扶持顧實汗的同時，順治帝還大力扶持達賴喇嘛，順治九年，五世達賴洛桑加措率領班禪及顧實汗的代表一行三千人赴京，經歷了長途跋涉，終于在年底抵達北京，經過反復斟酌，順治帝采用了一種特殊的方式迎接五世達賴一行，相聚那天，順治帝以田獵為名，與達賴相會于南苑獵場。
公元1722年，69歲的康熙帝因病去世，這位南征北戰，也為治理社稷江山而奔勞一生的皇帝，為清朝開啟了大治的時代，也基本奠定了一個統一國家的雛形。這一年，45歲的雍正皇帝登基，他在位13年，然而剛剛即為的雍正皇帝卻面臨著西藏分裂的挑戰，就在清軍驅逐策旺阿拉布坦的過程中，和碩特親王羅卜藏丹精以及青海和碩特各部首領曾隨清軍入藏，出了不少力，清廷為表彰他們的功勞，分別給予賞賜，并重新進行了人事安排，但早就想獨霸青海、西藏之地的羅卜藏丹津對清廷的安排大為不滿。
羅卜藏丹津于雍正元年發動的反清武裝叛亂，正式宣布要恢復先人的霸業，即據占西藏，遙控青海，剛剛登上皇帝寶座不久的雍正帝希望羅卜藏丹津能罷兵和睦，但羅卜藏丹津根本不聽勸告，清廷的反應迅速而強烈，雍正二年二月，雍正帝任命年庚堯為撫遠大將軍，從西寧急行軍，夜襲羅卜藏丹津，還在酣睡當中的羅卜藏丹津慌亂中換上女人的衣服，投奔準噶爾汗國，僅用十五天的時間，清軍便把面積六十萬平方公里的土地納入到管轄之下，解決了青藏地區的問題后，雍正帝又把視線轉向準噶爾部。
雍正五年，策旺阿拉布坦去世，其子噶爾丹策凌繼立，雍正七年，清廷決定兩路進軍西北，以解決準噶爾部的威脅，一直到雍正十一年冬，元氣大傷的噶爾丹策凌向清廷求和，雍正帝決定議和，希望準噶爾和喀爾喀兩部的游牧界限明確劃分，永息兵戈，準噶爾汗國的存在，客觀上使得清朝西部疆域保持了完整。
公元1735年，雍正帝去世，其子弘歷繼位，年號乾隆。公元1751年，乾隆皇帝開始了他的第一次南巡，這是一次歷時100多天的長途旅行，此次旅行，乾隆拜謁了明太祖陵，還登了泰山，乾隆帝放眼天下，可謂國泰民安，他心靜安逸，他發出諭旨，提倡百姓開墾荒地，以增加糧食產量。60年后，全國土地大約增加四五千萬畝，人口增加過億。
25歲登基，在位60年的乾隆帝，回顧他的平生，認為做了兩件大事，一件是用兵新疆，一件是六次南巡。公元1745年，乾隆執政第十年，久與清廷為敵，雍正帝一直沒有剿滅的噶爾丹策凌病逝，達瓦齊成為準噶爾部首領，1754年，策妄阿拉布坦的外孫阿穆爾薩納被達瓦齊擊敗后，率兵投降了清朝，十一月，乾隆帝從北京乘馬，疾馳三日，冒著嚴寒趕到避暑山莊，接見阿穆爾薩納一行。
