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干燥綜合征的病因目前仍不清楚，但國內外醫學者普遍認為與以下因素有關：

風濕骨病自身免疫干燥綜合征病人體內檢測出多種自身抗體如抗核抗體、類風濕因子、抗RNP抗體、抗SSA抗體、抗SSB抗體等以及高球蛋白血癥，反映了B淋巴細胞本身的功能高度亢進和T淋巴細胞抑制功能低下。遺傳基礎在對免疫遺傳的研究測定中，醫學家發現人類白細胞抗原中，HLA-DR3、B8與干燥綜合征密切相關;且這種相關又因種族的不同而不同，如西歐人與HLA-B8、DR3、DW52相關，日本人與HLA-DR53相關。病毒感染目前至少有三種病毒如EB病毒、巨細胞病毒、HIV病毒被認為與干燥綜合征有關，EB病毒能刺激B細胞增生及產生免疫球蛋白。病因：尚不明確，可能與EB病毒感染有關，并與HLA-B2、DR3有密切關系。