志賀氏菌屬是一類革蘭氏陰性桿菌，是人類細菌性痢疾最為常見的病原菌，通稱痢疾桿菌。
大小為0.5～0.7×2～3μm，無芽孢，無莢膜，無鞭毛。多數有菌毛。革蘭氏陰性桿菌。
為兼性厭氧菌，能在普通培養基上生長，形成中等大小，半透明的光滑型菌落。在腸道桿菌選擇性培養基上形成無色菌落。
分解葡萄糖，產酸不產氣。VP試驗陰性，不分解尿素，不形成硫化氫，不能利用枸櫞酸鹽作為碳源。宋內氏志賀氏菌能遲緩發酵乳糖（37℃ 3～4天）。
有K和O抗原而無H抗原。K抗原是自患者新分離的某些菌株的菌體表面抗原，不耐熱，加熱100℃1小時被破壞。K抗原在血清學分型上無意義，但可阻止O抗原與相應抗血清的凝集反應。O抗原分為群特異性抗原和型特異性抗原，前者常在幾種近似的菌種間出現；型特異性抗原的特異性高，用物區別菌型。根據志賀氏菌抗原構造的不同，可分為四群48個血清型（包括亞型）。
（1）A群：又稱痢疾志賀氏菌(Sh.dysenteriae)，通稱志賀氏痢疾桿菌。不發酵甘露醇。有12個血清型，其中8型又分為三個亞型。
（2）B群：又稱福氏志賀氏菌（Sh.flexneri），通稱福氏痢疾桿菌。發酵甘露醇。有15個血清型（含亞型及變種），抗原構造復雜，有群抗原和型抗原。根據型抗原的不同，分為6型，又根據群抗原的不同將型分為亞型；X、Y變種沒有特異性抗原，僅有不同的群抗原。
（3）C群：又稱鮑氏志賀氏菌（Sh.boydii），通稱鮑氏痢疾桿菌。發酵甘露醇，有18個血清型，各型間無交叉反應。
（4）D群：又稱宋內氏志賀氏菌（Sh.sonnei），通稱宋內氏痢疾桿菌。發酵甘露醇，并遲緩發酵乳糖，一般需要3～4天。只有一個血清型。有兩個變異相，即Ⅰ相和Ⅱ相；Ⅰ相為S型，Ⅱ相為R型。[1]
本菌對理化因素的抵抗力較其他腸道桿菌為弱。對酸敏感，在外界環境中的抵抗力能以宋內氏菌最強，福氏菌次之，志賀氏菌最弱。一般56～60℃經10分鐘即被殺死。在37℃水中存活20天，在冰塊中存活96天，蠅腸內可存活9～10天，對化學消毒劑敏感，1%石炭酸15～30分鐘死亡。
1．S-R型變異：宋內氏痢疾桿菌易為R型。當菌落變異時，常伴有生化反應、抗原構造和致病性的改變。
2．耐藥性變異：由于廣泛使抗生素，志賀氏菌的耐藥菌株不斷增加，給防治工作帶來多困難。
3．營養缺陷型變異：南斯拉夫Mel（1963年）首創的依賴鏈霉素的志賀氏菌株（依鏈株，Sd），作為口服菌苗可預防志賀氏菌痢疾。
1．侵襲力：志賀氏菌的菌毛能粘附于回腸末端和結腸粘膜的上皮細菌表面，繼而在侵襲蛋白作用下穿入上皮細胞內，一般在粘膜固有層繁殖形成感染灶。此外，凡具有K抗原的痢疾桿菌，一般致病力較強。
2．內毒素：各型痢疾桿菌都具有強烈的內毒素。內毒素作用于腸壁，使其通透性增高，促進內毒素吸收，引起發熱，神志障礙，甚至中毒性休克等。內毒素能破壞粘膜，形成炎癥、潰湯，出現典型的膿血粘液便。內毒素還作用于腸壁植物神經系統，至腸功能紊亂、腸蠕動失調和氫攣，尤其直腸括約肌痙攣最為明顯，出現腹痛、里急后重（頻繁便意）等癥狀。
3．外毒素：志賀氏菌A群Ⅰ型及部分2型菌株還可產生外毒素，稱志賀氏毒素。為蛋白質，不耐熱，75～80℃1小時被破壞。該毒素具有三種生物活性：①神經毒性，將毒素注射家兔或小鼠，作用于中樞神經系統，引起四肢麻痹、死亡；②細胞毒性，對人肝細胞、猴腎細胞和HeLa細胞均有毒性；③腸毒性，具有類似大腸桿菌、霍亂弧菌腸毒素的活性，可以解釋疾病早期出現的水樣腹瀉。
細菌性痢疾是最常見的腸道傳染病,夏秋兩季患者最多。傳染源主要為病人和帶菌者,通過污染了痢疾桿菌的食物、飲水等經口感染。人類對志賀氏菌易感，10～200個細菌可使10%～50%志愿者致病。一般說來，志賀氏菌所致菌痢的病情較重；宋內氏菌引起的癥狀較輕；福氏菌介于二者之間，但排菌時間長，易轉為慢性。
1．急性細菌性痢疾：分為典型菌痢、非典型菌痢和中毒性菌痢三型。中毒性菌痢多見于小兒，各型痢疾桿菌都可引起。發病急，常在腹痛、腹瀉未出現，呈現嚴重的全身中毒癥狀。
2．慢性細菌性痢疾：急性菌痢治療不徹底，或機體抵抗力低、營養不良或伴有其他慢性病時，易轉為慢性。病程多在二個月以上，遷延不愈或時愈時發。
部分患者可成為帶菌者，帶菌者不能從事飲食業、炊事及保育工作。
病后免疫力不牢固，不能防止再感染。但同一流行期中再感染者較少，即具有型特異性免疫。痢疾桿菌菌型多，各型間無交叉免疫。機體對菌痢的免疫主要依靠腸道的局部免疫，即腸道粘膜細胞吞噬能力的增強和SIgA的作用。SIgA可阻止痢疾桿菌粘附到腸粘膜上皮細胞表面，病后三天左右即出現，但維持時間短，由于痢疾桿菌不侵入血液，故血清型抗體（IgM，IgG）不能發揮作用。
在用藥前取糞便的膿血或粘液部分，標本不能混有尿液。如不能及時送檢，應將標本保存于30%甘油緩沖鹽水或增菌培養液中。中毒性菌痢可取肛門拭子檢查。
1．熒光菌球法：適于檢查急性菌痢的糞便標本。將標本接種于含有熒光素標記的志賀氏菌免疫血清液體培養基中，37℃培養4～8小時。如標本中有相應型別的痢疾桿菌，繁殖后與熒光素抗體凝集成小菌球，在低倍或高倍熒光顯微鏡下易于檢出。方法簡便、快速，有一定的特異性。
2．協同凝集試驗：用志賀氏菌的IgG抗體與富含A蛋白的葡萄球菌結合，以此為試劑，測定患者糞便濾液中志賀氏菌的可溶性抗原。
特異性預防主要采用口服減毒活菌苗，近年試用者有Sd株、2a變異株等。這些活菌苗雖有一定的預防作用，但免疫力弱，維持時間短，又服用量大、型間無保護性交叉免疫。故大規模應用還受一定限制。治療可用磺胺類藥、氨芐青霉素、氯霉素等。中藥黃連、黃柏、白頭翁、馬齒莧等均有療效。
中華人民共和國衛生部2012年5月17日最新頒部了GB4789.5-2012《食品安全國家標準 微生物學檢驗 志賀氏菌》，該標準于2012年7月17日起實施。該標準已將志賀氏菌增菌條件改為：樣品25g（25ml），于225ml志賀氏菌增菌肉湯-新生霉素中，于41.5℃厭氧培養16~20小時。該標準旨在提高志賀氏菌增菌環節的選擇性，以減少雜菌競爭抑制與干擾，提高志賀氏菌的擴增量，最終提高志賀氏菌的檢出率。由于即將面對大量250ml三角燒瓶的厭氧培養，常規的厭氧罐與厭氧袋均無法承擔，故厭氧工作站（或稱厭氧培養箱）即成為該增菌操作的首選設備。
