酵素是食物發酵后的產品，制作酵素的產品是糖和水果進行發酵之后的產物，也就是水果泡菜加上低度甜味水果、酒的混合物，其中糖分、多種有機酸、酒精等成分也有少量維生素。而市場上的酵素產品有些是粉末狀、片劑，有些是酵素原液，它們和酶是兩個概念。
自制酵素以蔬菜，水果為原料，經過加糖、密封，保存過程讓其充分發酵，最終得到可飲用的液體，但實際上就是一個自然發酵的過程。
由于是發酵的產物，有些產品中包含益生菌以及眾多微生物，在一定條件下，這些益生菌和微生物可以起到促進腸道蠕動的作用。
因此可以說，酵素本身并不具有通便減肥的功能，即使酵素產品在瘦身方面被證明有效，也不是酵素在起作用，而是發酵產物中的有益菌、微生物以及其他產品添加物的功效。
自制酵素的發酵環境的溫度是比較適宜微生物繁殖的，如果制作不成功，很有可能會產生一些雜質和有害物質，容易引起食物中毒。
另外，果膠經過微生物發酵之后可能會產生甲醇，在家中自制酵素，人們沒有后續去甲醇的工藝，這也是一種風險。
