大家知道，胎兒在母體內是無菌的，生后數小時腸道就有細菌進入、定居和繁殖，成為正常活菌群，即益生菌群。正常活菌與人體營養和免疫休戚相關，并與環境三方面構成生態平衡。腸道正常菌的構成主要是厭氧菌，包括雙歧桿菌95%，乳酸桿菌1%，其他厭氧菌3%，而需氧菌僅占1%。應用活菌制劑，即益生菌微生態治療，主要是指對人體有益并能拮抗腸道外籍菌的一類活菌制劑。
腹瀉時腸道正常菌群失常，厭氧菌能會減少1000倍。這樣，腸內會失去厭氧菌的屏障與拮抗作用，有利于外襲病原的攻擊和定植。此外，抗生素的不當使用會加重菌群紊亂和微生態失衡，促使腹瀉發生或加重，所以一定要合理使用抗生素。常用的活菌制劑主要是地衣芽孢桿菌活菌、雙歧三聯活菌和乳酶生等。
1.恢復腸道正常菌群和微生態平衡，提高厭氧菌主要是雙歧桿菌、乳酸桿菌等的數量和質量。
2.抵御病原菌的定植和侵襲，有利于腹瀉的控制。
3.減少慢性腹瀉的發生率。
1.益生菌要餐前服用。
2.益生菌不能用熱水沖調，服用時水溫不可超過37℃。
3.益生菌不能與抗生素同服，因為抗生素可能殺滅活菌。
4.益生菌不宜與收斂藥物同用，如藥用炭、鞣酸、酊劑、氫氧化鋁等，以免使益生菌失去活性。
5.益生菌多屬活菌，儲存和保管條件很重要。活菌怕熱、怕光、怕濕，所以溫度越高、光線越強、濕度越大，活菌存活時間越短。應在陰涼、干燥之處存放，最好放冰箱上層冷藏保存。
6.益生菌多屬于厭氧菌。所以不要把藥物長時間暴露于空氣中。由于益生菌均為小包裝，比如小袋、膠囊等，所以在使用前再打開包裝。如果使用含有益生菌的奶粉，要隨手蓋嚴奶粉罐。
1.如果有炎癥又有菌群失調，必須同時服用抗生素與益生菌的話，服用抗生素2小時后才能再服益生菌。
2.如果必須同時服用蒙脫石與益生菌，雖然都是飯前服用，兩者間隔應超過1小時。
3.如果抗生素、蒙脫石和益生菌三者都需要服用，可以依照上述順序服用，兩兩間隔應超過1小時。
