普洱茶的原料是云南大葉種和歷史上種植的的小葉種。據測定，大葉種的內含物比小葉種豐富。由于普洱茶要長期存放，存放過程中內含物質會不斷分解和釋放，茶葉重量會減輕，內含物豐富的大葉種茶才能更符合長期存放，因為內含物更豐富，使它存放多年后還有較多活性物質，還有味。
小葉種內含物少，長期存放分解釋后會淡而無味。07年普洱茶熱炒時，云南茶原料大漲，有人用外省小葉種發酵普洱茶，經發酵過程對茶葉物質的分解之后，茶雖然湯色紅亮，與大葉種發的無區別，但飲之無味。
歷史上的小葉種。在2006年制定的普洱茶國家標準中，普洱茶原料是云南大葉種。但是在云南50多個古茶園中有十多個古茶園中有小茶種。如倚邦、革登、莽枝、困鹿山、黃草壩、娜卡等。
其中倚邦曾是貢茶中心，有＂倚邦茶中因為有小葉種更香甜讓皇帝更喜歡＂的說法。有茶葉專家認為古茶園中的小葉種是大葉種的變異，但這個說法不對。
古茶園中的小葉種是外來種。理由有：一如果是自然變異，需要相當長的時間，大葉種的樹就要比小葉種的樹大很多、老很多才行，但古茶園中大、小葉種的茶樹是一樣大的。二把大、小葉種茶樹的茶葉分開制作后對比，口感滋味差異很大，大葉種比小葉種要更苦澀、更甜滑、湯質更飽滿、茶氣更強，而耐泡度幾乎差一倍。
因此普洱茶原料標準應該表述為：云南大葉種和歷史上種植于云南古茶園中的小葉種。
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