中醫學專不同的師承傳授關系，產生了不問的學術見解，這是產生醫學流派的條件。一些醫家根據自己的臨床經驗和學習心得，各創新說，形成了不同的學術流派。我國古代的醫學流派主要包括傷寒學派、寒涼學派、溫病學派、脾胃學派、滋陰派、攻邪派等。他們各有特色，各有創見，都從不同的角度豐富和發展了中醫學理論體系，促進了中醫學理論研究和臨床實踐的發展。
傷寒學派
傷寒學派是以研究或闡發張仲景《傷寒論》的辨證論治和理、法、方、藥為主要主張的眾多醫家形成的一大醫學流派。發端于晉唐時期，形成于宋金時期，興盛于明清時期，發展于近、現代。東漢末年著名醫家張仲景，在《內經》、《難經》的基礎上，進一步總結前人的醫學成就，并結合自己的臨證經驗，寫成了我國第一部臨床醫學專著《傷寒雜病論》，倡導以六經辨證和臟腑辨證等方法，對外感疾病和內傷雜病進行辨證論治，從而確立了中醫臨床醫學的辨證論治體系和理、法、方、藥的運用原則，為后世臨床醫學的發展奠定了良好的基礎，并成為歷代醫家辨證論治所遵循的經典著作。該書后經晉代醫家王叔和編纂整理成《傷寒論》與《金匱要略》兩部書。前書以闡述外感病辨治規律為主，后書則主要闡釋內傷雜病的辨治規律。
由于歷代醫家通過整理、編次、校勘、注釋《傷寒論》，融會進自己的臨證經驗與認識，豐富了傷寒學說的內容，擴大了應用范圍，提高了學術水平。傷寒學派內部不同派別的爭論，諸家對《傷寒論》條文的不同校勘與注釋、主客觀上成為傷寒學說不斷發展的動力，
寒冰派
是以宋金時代劉完素(劉河間)為代表的一個醫學流派。劉完素在研索《素問》、《傷寒論》的基礎上創立“火熱論”，受運氣學說的影響，強調“六氣皆從火化”、“五志過極皆能生火”，因而對火熱病機多有所闡發，寒涼派就是從運氣學說出發，探討火熱病機，擅長治療火熱病證、善用寒涼藥，后世稱為寒涼派，或河間學派。
攻邪學派
攻邪學派是以張從正(張子和)為代表，以攻邪為治病的首要任務，主張“六氣”致病，病由邪生，強調“邪留則正傷。”，“邪去則正安”、倡導以汗、吐、下三法攻邪而祛病，從而成為攻邪派。張從正的攻邪學說發揚了《內經》攻邪的有關理論，糾正了當時醫家盲目投補的現象，充實和發展了中醫辨證論治理論，對后世醫家如吳又可、趙學敏等治療某些疾病產生了深遠的影響。
脾胃學派
脾胃學派是李杲(李東垣)為代表，傳張元素之學，闡發《素問》“上者生萬物”的理論，創立了以補脾胃為主要治法的“脾胃論”，提出“內傷脾胃，阿病山生”的論點，認為疾病的發生，多與脾胃內傷有關，強調脾胃屬土，土為萬物之母，生化之源，脾胃病則百病莫不由之而生，因而對脾胃升降理論多有闡發，故而又稱“補土派”，脾胃學派創立的甘溫除熱等理論方法，慣于運用補中、升陽、益氣、益胃等法，對后世頗有影響，
滋陰派
滋陰派是以朱震亨(朱丹溪)為倡導者的，以養陰為主，強調保存陰氣對健康的重要意義的學派，又稱丹溪學派，朱丹溪受到河間學派火熱理論的影響，側重闡述陰虛火旺之證，其倡導“相火論”，謂“陽常有余，陰常不足”，主張滋陰降火，論治多以補陰為主，對“相火”學說多有所發揮。丹溪學派不僅以養陰為特色、還擅長治療氣、血、痰、郁等雜病，故有“雜病用丹溪”之說。
溫病學派
溫病學派是以研究溫熱病為中心的學術流派，溫熱病學，是研究四時溫熱疾病發生發展規律及其診治方法的學科，到了明清時期，隨著中醫學對傳染性熱病認識的逐步深化，創新和發展了溫熱學說，并形成了溫病學派，標志著對于溫熱疾病的認識和論治經驗，已經發展到了一個新的階段。其代表醫家首推明代的吳又可，他所著的《溫疫論》二書、首先提出了“戾氣”學說，認為“溫疫”的病原是'非風非寒非若非濕，乃天地IHJ別有一種異氣所成。，其傳染途徑是從口鼻而入，而不是從肌表侵襲。這是對溫病(特別是溫疫)病因學的很大突破與發展，為以后溫病學說的形成和完善奠定了基礎。著名溫病學家葉天士著《外感溫熱論》，發展了衛氣營血理論，創立衛氣營理論，吳鞠通著《溫病條辨》，創立了三焦辨證，并發展了三焦濕熱病機和臨床濕溫病辨證規律；薛生白著《濕熱病篇》，提出了'濕熱之病，不獨與傷寒不同“且與溫病大異”的獨到見解、而王孟英著《溫熱經緯》等，系統地總結了明清時期有關外感傳染性熱病的發病規律，突破了“溫病不越傷寒。”的傳統觀念，創立了以衛氣營血和三焦為核心的溫熱病辨證論治法則，從而使溫熱病學在病因、病機及辨證論治等方面形成了較為完整的理論體系，溫病學派的理論和方法，對后世臨床醫學的影響頗大，到目前為止仍具有較高的研究價值。
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