南宋朝廷在投降元朝之后，并不表示南宋滅亡了，只是代表南宋對元朝稱臣。宋恭帝投降后，忽必烈曾命令攻宋的大將伯顏將恭帝和太皇太后謝氏族等人帶到元朝首府大都來。但由于南宋還沒有滅亡，故一些有氣節(jié)不甘心宋朝對元朝稱臣的人開始了反元活動。
宋度宗共有3個兒子，其中二兒子做了宋恭帝，南宋被元軍攻占后，宋度宗的另外兩個兒子在生母楊淑妃和國舅楊亮節(jié)的護衛(wèi)下出逃，這二個兒子就是宋度宗長子益王趙昰和宋度宗三兒子廣王趙昺，他們在金華與南宋忠臣陸秀夫、張世杰、文天祥等人會合。幾位大臣旋即進(jìn)封趙昰為天下兵馬都元帥，趙昺為副元帥。成立了所謂的南宋流亡朝廷。
忽必烈得知此事后，立刻派大將伯顏繼續(xù)追擊南宋反抗勢力。由于元軍兇猛，于是南宋流亡朝廷被迫逃到了福州。不久，陸秀夫等人擁立剛滿7歲的趙昰登基做皇帝，是為宋端宗，尊楊淑妃為楊太后，加封弟弟趙昺為衛(wèi)王，張世杰為大將，陸秀夫主持政府，他們倆負(fù)責(zé)護主工作，而文天祥負(fù)責(zé)組織抗元工作，主要在外面作戰(zhàn)。張世杰、陸秀夫、文天祥儼然成為了南宋此時的三根支柱。
趙昰是個苦命的孩子，從他做皇帝開始就一直在逃亡，1277年，福州淪陷，宋端宗等人逃到泉州，后來由于元軍追擊的緊，又逃到了廣東。正當(dāng)宋端宗乘船準(zhǔn)備繼續(xù)逃亡到雷州的時候，不料遇到臺風(fēng)，船翻了，端宗落水差點溺死，雖留下一條命，但因此得病，不久還是死去了，隨后他的弟弟，只有7歲的衛(wèi)王趙昺又被擁立為皇帝，南宋朝廷繼續(xù)逃亡。當(dāng)陸秀夫和張世杰護衛(wèi)著趙昺逃到崖山的時候，因為背靠大海，無路可退，故這里就是南宋抗元最后的據(jù)點，而此時文天祥正在內(nèi)陸抗元，本來有了一點進(jìn)展，但最后還是沒有招架住元軍的強大攻勢，敗下陣來，并被擒。元軍在消滅了文天祥的抵抗后，直奔崖山追繳最后的南宋頑抗勢力。
祥興二年（1279年），元軍和宋軍在崖山相遇，此時宋軍的兵力有十萬，而元軍的兵力與之相當(dāng)。起初宋軍抵抗頑強，但無奈背水一戰(zhàn)，勢單力薄，最終無法抵擋元軍的沖擊，大敗。張世杰意識到大勢已去，于是抽調(diào)少量精兵，乘坐剩下的十余只船艦想突圍逃跑，但被元軍包圍。陸秀夫見怎么也無法突圍，他有著崇高的氣節(jié)，肯定不會做亡國奴，于是便背著八歲的趙昺投海，楊太后在聽說宋帝昺的死訊后也跟著跳海自殺，隨行的剩下的軍民也相繼跳海，當(dāng)時的場面甚為壯觀，據(jù)說有十萬人。
張世杰本希望再找宋朝趙氏后人為主，以期待以后還能重建大宋王朝的輝煌，但不幸的是，張世杰在大風(fēng)雨中也溺水而死。
崖山海戰(zhàn)，隨著宋朝最后一位皇帝的落水身亡，標(biāo)志著南宋的徹底滅亡，中國華夏族在歷史上第一次完全淪陷于外族，至此元朝正式統(tǒng)一中國。
知識延伸：南宋皇帝在位時間表
宋高宗趙構(gòu) 1127——1162年在位
宋孝宗趙昚 1162——1189年在位
宋光宗趙惇 1189——1194年在位
宋寧宗趙擴 1194——1224年在位
宋理宗趙昀 1124——1264年在位
宋度宗趙禥 1264——1274年在位
宋恭帝趙顯 1274——1276年在位
宋端宗趙昰 1276——1278年在位
宋衛(wèi)王趙昺 1278——1279年在位
