六、中藥學、方劑學和治療學
在中醫學的領域，西醫藥理學相對于中藥學和方劑學。某種意義上中醫對藥物、作用機理、藥效的解釋，依賴于臨床經驗與理性推斷，而西醫主要是實驗證實。但是，中藥藥理學近年來還是做了很大的貢獻的。
中藥學的一個特點是有藥性理論。除了有毒無毒這一部分與西醫的毒理學有一定的關系，其它四氣五味、升降浮沉、歸經都是中醫特有的。四氣就是指寒熱溫涼，用來治療熱性病和寒性病。五味指的是辛、甘、酸、苦、咸五種味道。辛味主要含揮發油，揮發油具有健胃、化濕、開竅、行氣、解熱鎮痛的作用。酸味主要是有機酸與鞣質，具有收斂、止瀉、止血的作用，可以治療燒傷、促進傷口愈合等等。甘味主要是糖、蛋白質、氨基酸，以營養成分為主，具有補益五臟氣血陰陽的作用，增強機體免疫力。苦味主要含生物堿和苷類，主要是抗菌、消炎、解熱、利膽、瀉下作用。咸味主要是含碘、鉀、鈣等無機鹽，具有化痰軟堅的功效。升降浮沉與歸經理論是指藥物作用的不同方向或者說趨勢、部位，也就是中藥的藥效呈現對機體器官部位的選擇性，以及藥物代謝動力學的作用使得藥物在體內分布不均勻，也就是我們講的“靶向性”，它在不同的器官分布不同。
與西醫不同，中醫強調聯合治療，進而形成了方劑學。方劑學的特點是君、臣、佐、使的配伍，但是西醫在這方面以單藥為主，即便聯合治療也沒有形成復雜的方劑學，甚至在腫瘤學科的聯合化療方案它都遠沒有達到方劑學的水平。
在治療上，中醫在治療學上是有特色的。一個特色的就是理法方藥的有機統一；第二個是有治則與治法；第三個有獨特的辨證論治體系。中醫特別強調理法方藥的一氣貫通。標本法、聚類法、平脈法、抓獨法、截斷法就體現了理法方藥的貫通。治則與治法也是我們的特點。治則包括標本緩急、扶正祛邪、調整陰陽、正治反治、同病異治、異病同治、三因制宜。治法比如說八法，這都是中醫的特點。這一套理論就使中醫存在著典型的個體性與整體性兼顧的特點，來處理病、證、癥。病是中醫的疾病；證是中醫的辨證論治；還有一個癥，就是癥狀。辨證論治從而出現異病同治與同病異治的特點。
辨證論治本質上是一個分層研究的思想。它的隨癥加減本質上是模糊數學的原理。我們在講中醫科研方法的時候講過，證的本質是機體對疾病的反應的不同，根據不同的人對疾病的反應不同分為不同的證型，同樣一個細菌感染，有陰虛的、陽虛的，出現不同的表現。陰虛的容易出現化熱，出現白虎湯證。陽虛的容易出現麻黃附子甘草湯證。根據同一個人由于自身的體質不同對同一個疾病病因（比如說細菌感染）應答的不同，從而表現出不同的證，所以出現個體性，就出現同病異治。由于對疾病應答的類型不同又出現了異病同治，比如說陽虛的人，很多疾病都可以用同一個方劑來處理，通過調整他的陽虛來改善疾病。
很多人認為西醫沒有同病異治與異病同治的特點，實際上西醫隨著分子分型與分子靶向治療的出現，也出現了同病異治與異病同治。比如乳腺癌經過分子分型，分為三型，然后采取不同的方法治療。同一個靶向藥物又可以治療不同的腫瘤，所以西醫也在進行分層研究，也有同病異治和異病同治，這是過去十多年西醫非常重要的一個進展。中醫的辨證論治是依賴于機體對疾病的反應，是一個病理生理的分型。西醫的分型是分子生物學的分型。因為基因決定著病理生理應答，所以分子生物學的分型的認識在某種程度上更深刻。隨著西醫的發展，將來在更大的層面上解決這些問題。
所以我們天天講中醫的辨證論治，我們天天講個體性與整體性兼顧，西醫在往這方面發展，對大家是一個激勵。我們從整體上認識生命，西醫的系統生物學也是從整體上認識生命。我們要深刻認識到西醫的進步。
由辨證論治引申出中醫的第二個特色整體觀的問題。西醫現在系統生物學的發展，從蛋白質和核酸的層面上對整體進行研究，包括系統化學對藥物提取的研究，也包括多元統計方法對疾病的多因素分析，已經發展得很快了。中醫最重要的這兩個特點，個體化和整體觀，西醫在這兩方面都有突飛猛進的發展，尤其是過去十多年，進展非常的快。
