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Cell:首個泛癌癥真菌生物組圖譜誕生

來源:網絡 2022-10-05 17:34

一個多世紀以來,科學家們一直在探索癌癥微生物(如細菌和病毒)之間的聯系,但鮮有研究關注真菌與癌癥的關系。最近幾年的大部分研究都聚焦在了整個人類微生物組上,特別是腸道,因為腸道中的細菌、病毒和真菌比人體其他地方的更為豐富且更加多樣化。然而,與癌癥相關的真菌發揮的作用和影響在很大程度上仍是未知的。真菌是比細菌和病毒更復雜的真核生物;而且,與細菌或病毒相比,含有細胞核的真菌與哺乳動物的細胞更為相似。
發表在《Cell》上的一項最新研究中,來自魏茨曼科學研究所和加州大學圣地亞哥分校的研究人員基于對35種癌癥及其相關真菌的調查,全面繪制了首個泛癌癥真菌生物組圖譜。
眾所周知,癌細胞與微生物有著長期而持久的聯系。它們在人體的生態系統中共同進化,競爭共享資源。這一過程中甚至會決定癌細胞、微生物和人類宿主的生存問題。
此前的研究已經發現,真菌核酸存在于大多數人類癌癥中。然而,真菌是如何進入腫瘤細胞的一直是個懸而未決的問題。但它符合包括腸道、口腔和皮膚在內的全身健康微生物組模式,細菌和真菌在這些地方相互作用,成為復雜菌群的一部分。
在人體上發現的真菌主要有兩種類型:一種是環境真菌,如酵母和霉菌。對于健康人來說,它們通常是無害的;另一種是共生真菌。它們生活在人體皮膚或體內,對人體有一些益處,如改善腸道健康;當然,也可能是有害的,如酵母感染或導致肝臟疾病。真菌也在塑造宿主免疫力方面發揮作用,這在免疫功能低下的人(包括癌癥患者)中顯得尤為突出。
在這項新研究中,該團隊在4個獨立隊列涉及35種癌癥的17401個患者組織、血液和血漿樣本中全面描述了與癌癥相關的真菌菌群。他們發現,在許多主要的人類癌癥中,真菌DNA和細胞的豐度較低,并且真菌菌群的組成會因癌癥類型而異。
真菌是未得到充分研究但極其重要的共生/機會性病原體,它們可以塑造宿主免疫力并感染免疫功能低下者。因此,應更好地探索真菌對人類健康的潛在影響,并通過微生物組視角重新檢查已知幾乎所有關于癌癥的東西。
研究人員在腫瘤中檢測到多種真菌-細菌-免疫生態。對真菌菌群與匹配的細菌組(微生物組的細菌組成)和免疫組(構成免疫系統的基因和蛋白質)進行比較的分析顯示,它們之間的關系通常是共生而不是競爭的。例如,一種真菌在50歲以上患者的乳腺癌腫瘤中富集,而另一種真菌在肺癌樣本中顯著富集。
此外,特定真菌與年齡、腫瘤亞型、吸煙狀況、對免疫治療的反應和生存措施之間存在顯著相關性。然而,這些真菌只是單純相關還是因果相關還有待進一步確定。
該團隊表示,這些發現證實微生物組在整體上是癌癥生物學的一個關鍵部分。因此,這項研究可能提供了重要的轉化機會,不僅在癌癥檢測方面,還可以在與藥物開發、癌癥進化、疾病后遺癥、復發和伴隨診斷相關的其他生物技術中應用。

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